nextimmune – Groupes de recherche participants 

Professeur Markus Ollert est un clinicien-chercheur, spécialiste certifié en dermatologie et en allergologie. Il est le premier directeur du Département Infection et immunité (DII) et est professeur d’allergologie clinique à l’Odense University Hospital de l’University of Southern Denmark. Avant de rejoindre le LIH, il a été directeur scientifique de la Clinical Research Division of Molecular and Clinical Allergotoxicology de la Technische Universität München (TUM), l’un des cinq centres allemands d’excellence en matière de recherche sur les allergies, qui sont financés par une subvention de recherche collaborative à grande échelle du ministère allemand de l’Éducation et de la Recherche (BMBF). Professeur Ollert a également été vice-président du département Dermatologie et allergie (TUM). Avant de s’installer au Luxembourg, il a été professeur de dermatologie et d’immunologie moléculaires à la TUM de Munich, en Allemagne. Il a également été l’un des membres fondateurs de la Graduate School in Information Science and Health (GSISH) de la TUM à Munich, fondée grâce à un financement de l’« Exzellenzinitiative » de la Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG). 

Professeur Brenner a suivi sa formation doctorale dans le cadre du programme d’immunologie des tumeurs du Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ) de Heidelberg (Allemagne) et poursuivi sa carrière de chercheur à l’Ontario Cancer Institute (OCI, Toronto, Canada). Il s’intéresse principalement à l’analyse des mécanismes de signalisation cellulaire, de la mort cellulaire et des paramètres de maladies in vivo dans le système immunitaire adaptatif et inné. Son équipe sera impliquée dans la plupart des modèles de maladies animales in vivo dans l’entièreté du programme NextImmune. Professeur Brenner jouit d’une reconnaissance internationale, comme en témoignent plusieurs publications de haut rang présentées comme « Research Highlight » dans la revue Nature Reviews Immunology et qui ont fait l’objet de commentaires dans le « Multiple Sclerosis Discovery Forum », un article récent dans la revue Nature Reviews Immunology ainsi que de multiples invitations en tant qu’orateur au Keystone Symposia. 

Le groupe de la plateforme centrale de bioinformatique dirigé par D^r Schneider a déjà développé un certain nombre de projets impliquant la gestion, le traitement et l’analyse de données médicales et biologiques à grande échelle. Le groupe a déjà mis en œuvre des plateformes de connaissances pour des projets d’intégration de données à grande échelle dans divers contextes pathologiques. En outre, le groupe met en œuvre un environnement informatique garantissant un environnement scientifique reproductible. La plateforme centrale de bioinformatique dispose d’une solide expertise en bioinformatique, en gestion, intégration et analyse des mégadonnées et en exploration de texte. D^r Schneider a été chef de groupe au Laboratoire européen de biologie moléculaire à Heidelberg (LEBM) pendant 8 ans avant de rejoindre le LCSB. Il possède une solide expérience d’entrepreneuriat, ayant fondé plusieurs entreprises dérivées, ou spin-offs. 

photo : (c) LCSB/University of Luxembourg

Le Groupe Cellules immunitaires et maladies inflammatoires (ICID) du professeur Jean-Luc Bueb (dont font partie la D^re Sabrina Bréchard et le D^rSébastien Plançon) explore les mécanismes associés aux fonctions pro-inflammatoires des neutrophiles. Au fil des années, le groupe a établi un modèle qui décrit la régulation de l’activité de la NADPH oxydase par le biais de voies de transduction du signal dépendant du calcium. 

L’équipe de recherche du D^r Chevigné l’équipe de recherche du Dr Chevigné se concentre sur les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) impliqués dans les pathologies induites par les virus, l’inflammation et le cancer, et s’appuie sur divers essais cellulaires établis en interne et sur des techniques de pointe permettant d’aborder les aspects les plus actuels de la liaison et de la signalisation des RCPG. Leurs principales réalisations en matière d’étude des déterminants de la reconnaissance, de l’activation et de la modulation des RCPG par des ligands endogènes et viraux comprennent l’identification d’une nouvelle interaction entre le virus et l’hôte du RCPG et l’application réussie de la technologie d’affichage de phages pour développer des antagonistes des RCPG à base de fragments d’anticorps. 

Ces dernières années, le Groupe Biologie computationnelle (CBG) dirigé par le professeur Del Sol  a consacré d’importants efforts au développement de modèles computationnels basés sur les réseaux pour l’étude de maladies complexes, de la reprogrammation et de la différenciation cellulaires. Le CBG a également conçu des approches basées sur les réseaux pour l’identification des réseaux de régulation complexes qui sous-tendent les transitions cellulaires liées à la progression de la maladie. En outre, professeur Del Sol possède une expertise en matière de développement biotechnologique dans le cadre d’une entreprise. 

photo : (c) Michel Brumat / University of Luxembourg

D^r Desai  a obtenu son doctorat à l’International Max Planck Research School de Marbourg, en Allemagne, et a effectué des études postdoctorales à la Georg-August-Universität Göttingen, en Allemagne, ainsi qu’à l’University of Michigan Medical School, aux États-Unis. Il s’intéresse actuellement au microbiome intestinal humain et aux rôles qu’il joue dans la santé et la maladie. Bien que l’alimentation soit un acteur important de la physiologie du microbiote, les mécanismes médiés par le microbiote intestinal qui lient l’alimentation aux troubles intestinaux et aux infections entériques sont mal compris. Ses travaux de recherche visent à identifier ces mécanismes et les processus éco-immunologiques sous-jacents grâce aux interactions entre la barrière muqueuse colique et le microbiote intestinal. Il a présenté ses recherches dans diverses réunions internationales comme les conférences Gordon et Keystone, et a reçu des prix de la part d’organisations de premier plan telles que l’American Society for Microbiology, la Microbiology Society (Royaume-Uni), l’International Society for Microbial Ecology et l’Irish Society for Immunology. 

Le Groupe Recherche clinique et translationnelle sur le VIH (VIH-RCT) dirigé par la D^re Devaux souhaite fournir de nouvelles connaissances translationnelles sur un remède contre le VIH à l’aide de modèles murins humanisés, en particulier sur la réponse spécifique au VIH des sous-ensembles cytotoxiques de cellules T CD8 et de cellules NK. Le groupe a également mené des recherches sur le développement de molécules thérapeutiques multifonctionnelles hétéromultimériques qui activent l’activité du complément vis-à-vis des cellules cibles et sur le développement d’antiviraux dérivés de produits naturels. Le groupe est partenaire de plusieurs réseaux européens de lutte contre le VIH et le VHC. 

Le Groupe Systèmes de contrôle dirigé par le professeur Goncalves consacre la majeure partie de ses efforts à l’élaboration de théories et d’approches pour l’analyse des données dynamiques. Le groupe a ainsi adapté des outils issus des domaines des systèmes de contrôle et de l’apprentissage automatique pour découvrir comment les molécules (ou nœuds) dans des réseaux complexes se régulent mutuellement et comment ces régulations varient en réponse à des changements génétiques ou environnementaux. Le groupe décrit l’application et le développement de nouveaux outils mathématiques qui facilitent la cartographie rapide et sans biais ainsi que la modélisation dynamique des réseaux biologiques, et qui permettent d’identifier les modifications spécifiques des systèmes qui sous-tendent des comportements biologiques complexes. Ces dix dernières années, avant de rejoindre le LCSB, professeur Goncalves a travaillé comme chargé de cours et maître de conférences à l’University of Cambridge. 

photo : (c) LCSB/University of Luxembourg

D^r He a mis en place une filière originale d’innovation en biologie des systèmes en développant une stratégie de découverte de gènes clés basée sur les réseaux de corrélation, qui va de la génération de données « omiques » de séries temporelles à grande échelle à l’analyse des réseaux, en passant par la prédiction de nouveaux gènes clés et la validation expérimentale. Sa stratégie guidée par les réseaux a permis de découvrir plusieurs nouveaux gènes clés dans divers sous-ensembles de cellules T CD4+. Des découvertes qui ont soit fait l’objet d’un article récent dans des revues de premier plan comme Molecular Systems Biology, soit été brevetées. Il travaille actuellement sur l’immunologie des systèmes en intégrant la biologie des réseaux à l’immunologie. Il a récemment été choisi comme orateur pour des conférences de premier plan sur la biologie des systèmes, telles que l’International Conference in Systems Biology (ICSB) et l’International conference on Systems Biology of Human Diseases (SBHD). 

D^re Hilger a concentré ses recherches sur les allergènes respiratoires d’origine animale. Son équipe a réussi à isoler les allergènes de différents petits animaux de compagnie, à augmenter la spécificité du diagnostic basé sur les IgE en utilisant ces nouveaux composants moléculaires, et à démontrer la réactivité croisée des IgE entre les principaux allergènes animaux provenant de sources différentes. Cela a permis d’expliquer les schémas complexes de sensibilisation clinique aux squames animales. D^re Hilger possède également une longue expérience dans le domaine des allergies alimentaires et entretient une étroite collaboration avec l’Unité Immunologie et allergologie du CHL. D^re Hilger jouit d’une grande visibilité internationale. Elle a en effet été invitée à participer au groupe de travail sur l’allergologie moléculaire de l’EAACI (European Academy of Allergy and Clinical Immunology), à assister aux congrès internationaux de l’EAACI ainsi qu’à des conférences organisées par les sociétés française et allemande d’allergologie et d’immunologie clinique. Elle a récemment été nommée membre du WHO/IUIS Allergen Nomenclature Sub-Committee. 

D^re Kuehn a effectué des recherches fondamentales dans le domaine de l’allergie alimentaire. Les résultats de ses recherches relatives aux allergies aux poissons ont contribué de manière significative à une meilleure compréhension des tableaux cliniques des patients allergiques aux poissons et à de nouvelles perspectives de développement de diagnostics novateurs basés sur des composants d’allergènes spécifiques. Outre une collaboration étroite avec l’Unité Immunologie et allergologie (CHL), D^re Kuehn a établi un réseau international de cliniciens qui collaborent à divers projets sur les allergies alimentaires. La reconnaissance internationale dont elle bénéficie s’est traduite par une invitation à participer au groupe de travail sur l’allergologie moléculaire de l’EAACI (European Academy of Allergy and Clinical Immunology), par des invitations à des réunions de l’EAACI ainsi qu’à des conférences des sociétés française et allemande d’allergologie. Sur invitation, elle a écrit plusieurs revues et chapitres de livres. 

D^re Perez Bercoff possède une longue expérience de la recherche sur le VIH. Après avoir travaillé sur l’identification des acteurs de la résistance à l’infection par le VIH au cours de son doctorat, elle s’est penchée pendant de nombreuses années sur la résistance virale aux traitements antirétroviraux, et plus particulièrement sur l’évolution et la sélection virales sous la pression thérapeutique et sur le développement d’outils virologiques. Ses travaux ont donné lieu à des publications dans des revues internationales évaluées par des pairs et à l’obtention d’une licence pour un outil bioinformatique permettant de typer le VIH. Dernièrement et en collaboration avec le laboratoire du professeur Simon Wain-Hobson de l’Institut Pasteur de Paris, elle s’est également concentrée sur les liens moléculaires entre l’inflammation et le développement du cancer. Un doctorant sera engagé afin d’étudier le rôle de l’APOBEC3A dans les infections virales chroniques. 

D^re Perez Bercoff co-supervisera également un projet de doctorat associé à NextImmune, qui est financé par le Réseau européen de formation Marie Sklodowska-Curie (GA 642434) : « ANTIVIRAUX : un réseau européen de formation sur le développement de médicaments antiviraux (ANTIVIRALS: a European Training Network on Antiviral Drug Development) », en collaboration avec la société de biotechnologie COMPLIX (D^re Sabrina Deroo). 

Au cours de séjours postdoctoraux couronnés de succès au Centre du Luxembourg pour la biomédecine des systèmes et au Cancer Research UK Beatson Institute de Glasgow, tous deux soutenus par des bourses individuelles compétitives, D^r Johannes Meiser s’est spécialisé dans le métabolisme des cellules de mammifères, plus particulièrement dans le cadre du cancer et de l’immunométabolisme. Il est ensuite passé avec succès à un poste de chercheur principal au LIH, principalement financé par le programme ATTRACT du FNR (un programme menant à la titularisation sur 5 ans de 1,5 million d’euros). Grâce à des financements externes supplémentaires provenant du Luxembourg et de l’étranger, le laboratoire s’est agrandi et compte aujourd’hui 7 membres (3 doctorants, 2 postdoctorants et 1 technicien). Les compétences fondamentales du laboratoire du D^r Meiser sont l’analyse quantitative du métabolisme des cellules de mammifères au moyen de l’analyse des flux métaboliques assistée par des isotopes stables et de la chimie analytique. 

D^r Turner et son groupe de recherche travaillent sur les mécanismes immunoendocriniens et immunoépigénétiques. L’équipe possède une expertise largement reconnue dans la régulation génétique et épigénétique de l’activité anti-inflammatoire et des hormones de stress, en particulier celles de l’axe hypothalamo-hypophyso-surrénalien (HHS). Les recherches du D^r Turner vont des études mécanistes in vitro aux études précliniques (modèles de souris et de rats) et humaines. Ses travaux ont démontré les effets significatifs sur l’épigénome des stimuli environnementaux qui contribuent au développement de l’axe HHS et du phénotype immunitaire, en particulier par le biais de défis pour le système immunitaire (p. ex. les LPS) et d’adversité (p. ex. le placement en institution) pendant la petite enfance, ainsi que les interactions entre génotypes et épigénotypes. 

Au cours de sa thèse de doctorat, D^r Zimmer a été le premier à étudier en profondeur le phénotype et les fonctions des cellules tueuses naturelles dans la déficience en ATP chez l’homme (J. Exp. Med. 1998, Eur. J. Imunol. 1999). Depuis, il a participé à la caractérisation de plusieurs autres conditions et a poursuivi l’étude des cellules NK dans cette maladie. Au cours de son séjour postdoctoral à Lausanne (au Ludwig Institute for Cancer Research), il a découvert que les cellules NK sont capables de trogocytose (J. Exp. Med. 2001), ce qui a directement conduit à la création du modèle des interactions-cis de l’éducation des cellules NK, modèle qu’il a aidé à établir (Nat. Immunol. 2004). D^r Zimmer est internationalement reconnu pour son travail sur les cellules NK. Il est actuellement professeur assistant associé à l’Université du Luxembourg. D^r Zimmer est directeur adjoint des affaires académiques du Département Infection et immunité.