Plateforme de Métabolomique
La plateforme METABO est dédiée à l’étude des petites molécules, en particulier des métabolites polaires et des lipides.
activités
La plateforme METABO est dédiée à l’étude des petites molécules, en particulier des métabolites polaires et des lipides. Notre mission est d’appliquer et de faire progresser les approches métabolomiques dans le domaine de la recherche biomédicale, avec un accent particulier sur le cancer. Au-delà de l’utilisation des techniques de pointe en métabolomique, nous développons et implémentons activement de nouvelles méthodes analytiques afin d’étendre l’exploration du métabolome et de soutenir des axes de recherche émergents.
Nous réalisons des analyses métabolomiques sur divers types d’échantillons, notamment les fluides biologiques, les extraits cellulaires et les échantillons d’organes. Grâce à un répertoire diversifié de méthodes analytiques, nous couvrons les principales voies métaboliques et assurons une exploration approfondie du métabolome. Notre expertise repose sur la métabolomique et la lipidomique basées sur la spectrométrie de masse, grâce à deux instruments LC-MS (chromatographie liquide – spectrométrie de masse) équipés de la technologie Orbitrap (Thermo) :
- Vanquish Flex LC couplé à un Orbitrap Q Exactive Plus
- Utilisé pour l’analyse en routine de petits métabolites polaires, y compris les intermédiaires glycolytiques et du cycle de Krebs (TCA), les acides aminés et leurs isotopologues marqués au ¹³C.
- Vanquish Horizon LC couplé à un Exploris 480
- Conçu pour une large gamme d’applications, notamment la quantification des phospholipides, des acides gras à chaîne courte, les expériences de traçage au deutérium, ainsi que la quantification des métabolites polaires et de leurs isotopologues marqués au ¹³C.
Nos capacités en traitement des données incluent des approches ciblées et non ciblées, garantissant une analyse métabolomique précise et exhaustive.
Enfin, la formation de la prochaine génération de chercheurs est au cœur de notre mission. Nous proposons ainsi un programme de formation complet, associant théorie et pratique, pour accompagner le développement des compétences en métabolomique.
Legrave
Chef de la Plateforme Métabolomique
Membres de l’équipe
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François
Bernardin Laboratory Technician -
Monika
Dieterle Research Engineer -
Nathalie
Legrave Head of Metabolomics Platform
Publications scientifiques
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Metformin impacts the differentiation of mouse bone marrow cells into macrophages affecting tumour immunity – 30/09/2024
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PKM2 diverts glycolytic flux in dependence on mitochondrial one-carbon cycle – 28/02/2024
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Corrigendum: PHGDH is required for germinal center formation and is a therapeutic target in MYC-driven lymphoma – 15/02/2024
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Proteomic analysis of horse hair extracts provides no evidence for the existence of a hypoallergenic Curly Horse breed – 01/02/2024
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Phenotypic profiling of solute carriers characterizes serine transport in cancer – 26/10/2023
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Cross-Talk between miRNAs from the Dlk1-Dio3 Locus and Histone Methylation to Protect Male Cerebellum from Methyl Donor Deficiency – 01/01/2023
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Formate promotes invasion and metastasis in reliance on lipid metabolism – 30/08/2023
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Quantification of 782 Plasma Peptides by Multiplexed Targeted Proteomics – 01/01/2022
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Formate overflow drives toxic folate trapping in MTHFD1 inhibited cancer cells – 01/01/2023
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Pyruvate dehydrogenase fuels a critical citrate pool that is essential for Th17 cell effector functions – 26/02/2023
