Multi-omics Data Science Forschung
Die Multi-omics Data Science Research (Multi-omics Data Science Forschung) Group beschäftigt sich mit der Entwicklung fortschrittlicher Berechnungs- und Statistikmethoden für die Analyse und Interpretation biomedizinischer Daten.
Tätigkeiten
Der Hauptschwerpunkt der Multi-omics Data Science Group liegt auf Daten, die in der Krebsbiologie mit Hochdurchsatztechnologien für die Erstellung molekularer Profile gewonnen werden. Wir beschäftigen uns damit, relevante biologische Signale und prädiktive Merkmale aus Tumoren und umgebenden Geweben in verschiedenen Modalitäten zu extrahieren: DNA-Methylierung, RNA-Expression, Proteinabundanz und histopathologische Bilder von Geweben. Die Integration der zugehörigen Daten verbessert unser Verständnis der Krebserkrankungen und führt zu einer besseren Patientenstratifizierung und Behandlung. Sehr wichtig ist der Gruppe, einen Beitrag zur einer translational ausgerichteten Forschung durch intensive Kooperationen am LIH, dem LNS ebenso wie im Ausland zu leisten. Mitglieder des Teams ermöglichen interdisziplinäre Forschungspartnerschaften, die von ihrer vielfältigen Fachkompetenz profitieren: in Biostatistik, in der groß angelegten Analyse und Integration von Multi-Omik-Daten, in maschinellem Lernen und Programmierung für wissenschaftliche Projekte.
Petr Nazarov leitet die Forschungsgruppe Multi-omics Data Science am Luxembourg Institute of Health und ist als Gast in der Funktion Assistant Professor an der Universität Luxemburg tätig. Er schloss er sein Physikstudium 2000 an der Belarusian State University ab und promovierte 2006 in Biophysik an der Universität Wageningen. Seitdem arbeitet er am Luxembourg Institute of Health, zuerst als Postdoc, Forscher und schließlich als Gruppenleiter. Seine Kompetenzen liegen in erster Linie in den Bereichen Biostatistik, Datenanalyse, maschinelles Lernen und Genomik. In seiner Arbeit beschäftigt er sich vor allem mit der Analyse der Transkriptome von Krebserkrankungen. Sein besonderes Interesse gilt der Dekonvolution von transkriptomischen und epigenomischen Signalen aus heterogenen Tumoren.
Nazarov
Projekte und klinische Versuche
research projects
Die Mitglieder der Gruppe haben folgende Forschungsprojekte geleitet oder dazu beigetragen:
- Decomposition of mixed transcriptomes for classification of heterogeneous tumour samples (DEMICS)“; gefördert vom luxemburgischen Forschungsfonds (Fonds National de la Recherche, FNR), 2018-2020.
- „Glioma longitudinal analysis in Luxembourg: ex vivo and in vivo functional profiling of recurrent gliomas“ (GLASS-LUX); gefördert vom FNR, 2021-2024.
- „Targeting tumor propagating cells in glioblastoma: from mechanistic insights to precision medicine“ (SUNRISE); gefördret von Télévie PDR, Luxemburg-Belgien, 2021-2024.
Ausgewählte Teammitglieder
Wissenschaftliche Veröffentlichungen
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Integrated single-cell analysis reveals distinct epigenetic-regulated cancer cell states and a heterogeneity-guided core signature in tamoxifen-resistant breast cancer – 18/11/2024
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Adenoviral delivery of the CIITA transgene induces T-cell-mediated killing in glioblastoma organoids – 13/11/2024
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Patient-based multilevel transcriptome exploration highlights relevant chemokines and chemokine receptor axes in glioblastoma – 30/09/2024
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Digital voice-based biomarker for monitoring respiratory quality of life – 01/10/2024
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Metformin impacts the differentiation of mouse bone marrow cells into macrophages affecting tumour immunity – 30/09/2024
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PARK7/DJ-1 deficiency impairs microglial activation in response to LPS-induced inflammation – 16/07/2024
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consICA – 13/07/2024
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AllergoOncology – 01/01/2024
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Most accurate mutations in SARS-CoV-2 genomes identified in Uzbek patients show novel amino acid changes – 31/05/2024
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Enhancing the opportunities for cholangiocarcinoma precision therapy – 16/01/2024
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