NextImmune - Programme de formation doctorale
Projets individuels – Génération de données
Projets 1 et 2 : développement des maladies inflammatoires et des lymphomes
- Supervision: Prof Dirk Brenner, 2 doctorants, LIH, SDU-UL
- Mots-clés de la recherche : inflammation, régulation immunitaire, auto-immunité, lymphome
- Collaborations: Tak Mak (University of Toronto), Jürgen Ruland (TUM, Munich), Philipp Lang (University of Dusseldorf), Karl Lang (Uniklinik Essen)
Le projet de doctorat envisagé s’articulera autour de l’étude de la régulation immunitaire. Le premier centre d’intérêt de notre groupe de recherche est la manière dont l’inflammation et les réponses auto-immunes sont contrôlées à la périphérie du corps, et le second la manière dont ces mêmes facteurs contribuent au développement des lymphomes.
L’ubiquitination des protéines, la signalisation à NF-ĸB et les adaptations métaboliques sont notamment apparues comme des mécanismes clés de régulation de l’homéostasie immunitaire. La manière dont les différents signaux déclenchés dans diverses affections inflammatoires sont intégrés pour garantir une réponse immunitaire coordonnée et le maintien de l’homéostasie est encore mal comprise. À cet égard, nous analysons les circuits de régulation du système immunitaire inné et adaptatif. Une meilleure compréhension de la manière dont les réactions inflammatoires sont équilibrées fournira de nouvelles perspectives sur le déclenchement et des traitements potentiels des maladies inflammatoires et des hémopathies malignes.
Un doctorant a été recruté pour ce projet.
Projet 3 : gatekeepers métaboliques dans les cellules immunitaires : prise de décision et contrôle de l’inflammation in vivo
- Supervision: Prof Dirk Brenner, 1 doctorant, LIH, UL
- Mots-clés de la recherche : régulation immunitaire, métabolisme, inflammation
- Collaborations: Johannes Meiser (LIH, Luxembourg), Karsten Hiller (University of Braunschweig, Germany)
Un contrôle rigoureux du système immunitaire est essentiel au bon fonctionnement de l’organisme. Une immunité déséquilibrée peut entraîner des maladies préjudiciables comme l’inflammation systémique, l’auto-immunité ou le cancer. Des schémas métaboliques inadéquats au sein des cellules immunitaires activées sont à la base de nombreuses réponses immunitaires aberrantes, ce qui implique que la manipulation du métabolisme de ces cellules pourrait renforcer ou tempérer l’immunité de manière bénéfique. Dans le cadre de ce projet de doctorat, nous étudions de nouvelles pistes de redirection des flux métaboliques in vivo et comment cela est associé aux maladies immunitaires et inflammatoires. Il est essentiel d’étudier de nouveaux concepts de régulation métabolique dans des contextes in vivo spécifiques au type cellulaire ainsi qu’à la maladie inflammatoire afin de découvrir la prochaine vague d’options thérapeutiques innovantes.
Un doctorant a été recruté pour ce projet.
Projet 4 : cellules tueuses naturelles (NK) dans l’inflammation pulmonaire chronique : effecteurs ou libérateurs d’exosomes ?
- Supervision: Dr Jacques Zimmer, 1 doctorant, LIH, UL-SDU
- Mots clés de la recherche : immunologie, cellules NK, déficience en TAP, exosomes
- Collaborations: Karl-Johan Malmberg (University of Oslo, Norway)
L’objectif de ce projet est de définir de nouvelles voies de réponses antibactériennes et de communication cellulaire par les exosomes dans les cellules NK.
L’intégration de ce projet au sein de la DTU se concrétise par une collaboration avec le groupe du Dr Feng He dans le projet « Potentiel de réponse Th2 (Th2 response potential) » qui vise à clarifier l’implication des cellules NK et le rôle des exosomes dérivés des cellules NK dans la phase précoce d’induction de la tolérance innée.
Un doctorant a été recruté pour ce projet.
Projet 5 : le rôle du gêne IRG-1 dans les maladies inflammatoires (vasculaires)
- Supervision: Dr Johannes Meiser, 1 doctorant, LCSB, UL-SDU
- Mots clés de la recherche : gène de réponse immunitaire 1, acide itaconique, athérosclérose inflammatoire, inflammation, métabolisme
- Recherche de pointe : définition d’un nouvel acteur comme mécanisme cible potentiel pour les maladies inflammatoires vasculaires
- Collaborations: Prof Jochen Schneider (Co-superviseur, LCSB), Dr Alessandro Michelucci (LIH), Dr Alex Skupin (LCSB)
Les maladies inflammatoires vasculaires telles que l’athérosclérose ou la vascularite affectent un grand nombre de personnes dans le monde. Les maladies vasculaires étant une inflammation induite par les lipides, leur physiopathologie nécessite une modification du métabolisme et du système immunitaire. L’IRG1 est un gène spécifiquement exprimé dans les cellules myéloïdes lors de l’activation du système immunitaire, en réponse aux stimuli bactériens ou à l’exposition aux oxLDL par exemple. La production IRG-1 dépendante du métabolite acide itaconique (ITA) interfère directement avec le métabolisme du cycle cellulaire de l’acide tricarboxylique (TCA). L’IRG-1 intervient également dans la production et l’homéostasie des espèces réactives de l’oxygène (ROS). Si ces données suggèrent que l’IRG-1 connecte l’activation immunitaire innée au métabolisme, son rôle dans l’athérosclérose n’est pas défini. Notre objectif dans ce projet est de caractériser le rôle de l’IRG-1 dans les maladies vasculaires inflammatoires in vivo et in vitro. Ce projet vise à définir un nouvel acteur comme mécanisme cible potentiel des processus inflammatoires dans le système vasculaire.
Un doctorant a été recruté pour ce projet.
Projet 6 : profilage de l’interaction des allergènes avec les cellules de l’interface épithéliale
- Supervisor: Dr Christiane Hilger, 1 PhD student, LIH,
- Supervision : Dre Christiane Hilger,1 doctorant, LIH, SDU-UL
- Mots clés de la recherche : allergie, allergènes animaux
- Collaborations : Dr Gunnar Dittmar (LIH), Dre Paulette Charlier (CIP, Liège), Dre Martine Morisset (CHL, Luxembourg
Les mécanismes de la liaison, de l’absorption et du traitement cellulaire des allergènes animaux et de leur modulation immunitaire présumée ne sont pas encore totalement caractérisés. L’élucidation des voies cellulaires induites par les allergènes animaux est cruciale pour la compréhension des réponses immunitaires allergiques aux animaux et peut, à terme, conduire à de nouvelles approches thérapeutiques.
Un doctorant a été recruté pour ce projet.
Projet 7 : mécanismes moléculaires de l’inflammation chronique liés au développement du cancer
- Supervision : Dre Danielle Perez Bercoff,1 doctorant, LIH, UL-SDU
- Mots clés de la recherche : infections virales chroniques, inflammation chronique, cancer, mutation de l’ADN, gènes stimulés par l’IFN
- Collaborations : Simon Wain-Hobson (Institut Pasteur, Paris)
L’inflammation chronique est un facteur important du développement du cancer. Cependant, à quelques exceptions près (ROS, NF-κB), les mécanismes moléculaires liant l’inflammation au développement du cancer restent flous. Dans ce projet, le doctorant étudiera le rôle de l’enzyme APOBEC3A, un mutateur d’ADN, et son rôle dans la transformation cellulaire.
Un doctorant a été recruté pour ce projet.
Projet 8 : signalisation calcique pro-inflammatoire et sécrétion de cytokines dans les neutrophiles (CASIS)
- Supervision : Professeur Jean-Luc Bueb, 1 doctorant, LSRU, UL
- Mots clés de la recherche : inflammation, neutrophiles, signalisation calcique, cytokines, granules sécrétoires.
Selon des avancées récentes, la sécrétion et la dégranulation des cytokines dérivées des neutrophiles pourraient jouer un rôle majeur dans le développement et la résolution des réponses inflammatoires.
Ce projet a pour objectif de décrypter le rôle du Ca2+ dans le traitement des granules cellulaires et la sécrétion de cytokines. Les expériences seront réalisées sur des neutrophiles et des lignées cellulaires humains (et éventuellement de souris), dans des situations saines et d’inflammation pathologique, dans des conditions stimulées/modulées (LPS, fMLF/2-APB, BAPTA…), afin d’identifier les mécanismes cellulaires conduisant aux maladies inflammatoires chroniques (arthrite rhumatoïde, inflammation liée au cancer…).
Un doctorant a été recruté pour ce projet.
Projet 9 : programmation immunitaire pendant la petite enfance
- Supervision : Dr Jonathan Turner,1 doctorant, LIH, UL-SDU
- Mots-clés de recherche : épigénétique, programmation pendant la petite enfance, stress
- Collaborations : Professeur Wim Vanden Berghe (University of Antwerp, Belgique)
Ce projet est basé sur l’induction de phénotypes de l’axe immunitaire et de l’axe HHS après des expositions environnementales durant la petite enfance connues pour augmenter significativement le risque de maladie plus tard dans la vie, et sur l’examen des mécanismes épigénétiques sous-jacents par l’identification des biomarqueurs de classification potentiels. Les objectifs de ce projet sont doubles : déterminer les mécanismes sous-jacents à la programmation immunitaire tout au long de la vie, et démontrer la validation de principe de la réversibilité de la programmation épigénétique des systèmes immunitaire et endocrinien.
Un doctorant a été recruté pour ce projet.
Projet 10 : Identification d’allergènes alimentaires dans les sérums des personnes allergiques et non allergiques
- Superviseur junior : Dre Annette Kuehn (superviseur principal), co-superviseur : Professeur Markus Ollert, conseiller principal DTU : Claude Muller, 1 doctorant, LIH, SDU-UL
- Mots clés de la recherche : allergie alimentaire, traitement des allergènes, tolérance orale
- Collaborations : Carsten Bindslev-Jensen (Odense, Danemark), Yeoun Jin Kim (LIH)
Le présent projet vise à identifier les peptides d’allergènes alimentaires résistants à la digestion qui circulent dans le sang d’individus sains et allergiques. L’un des principaux objectifs de ce projet est le développement d’une méthode d’analyse peptidique des allergènes alimentaires dans les sérums de personnes saines/allergiques.
Ce projet couvre les domaines A et C de NextImmune.
Un doctorant a été recruté pour ce projet.
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Conseil consultatif scientifique
- Domaine A: Génération de données
- Domaine B: Analyse informatique
- Domaine C: Validation et évaluation des cibles précliniques
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